카모메 학원에 전해오는 가장 유명한 7대 불가사의에 대한 소문. 구 교사 3층 여자 화장실 세 번째 칸에는 하나코 씨가 있는데 불러낸 사람의 소원을 무엇이든 이뤄준대. 부르는 방법은 간단해 노크를 3번. 그리고─── '하나코 씨, 하나코 씨, 계신가요?' '네-에-……' 자신의 소원을 이루기 위해 하나코 씨를 부른 오컬트 소녀 야시로 네네. 하지만, 그녀의 앞에 나타난 것은 남자아이의 유령 '하나코 군'이었다. 요괴이지만 가학적이고 조금은 엉큼한 하나코 군에게 휘둘리며 다양한 괴담에 휘말리는 네네. 과연 네네는 무사히 학원 생활을 보낼 수 있을 것인가 누구도 본 적 없는 하트풀 화장실 코미디가 지금 시작된다....