로봇 샘플이 갑자기 인간을 공격하는 사건이 잇달아 발생한다. 동일한 모델의 로봇 회수에 나선 쿠사나기 팀은 그 로봇들에게서 한 가지 공통점을 발견한다. 바토와 토구사는 사건의 진상을 밝히기 위해 로봇 제조사인 한카 정밀로 향한다.