외딴섬에서 고등학교에 다니며 '침략종' 구제를 담당하는 헌터 소녀 쿠제 시이나. 여동생 세츠나와 둘이서 평화롭게 지내고 있었지만, 정체불명의 남자의 습격으로 인해 시이나는 '마인'을 둘러싼 운명에 휘말리게 된다.